Kako je saopšteno iz kabineta kosovskog premijera, Hodžaj je bivši pripadnik Oslobodilačke vojske Kosova i deo je Policije Kosova od 2001. godine, gde je obavljao različite fukcije, kao šef Jedinice za istrage o privrednim zločinima i nedavno šefa Opšte istražne jedinice u Đakovici.
Emin Hodžaj je završio studije na Pravnom fakultetu Univerziteta u Prištini.